Продукты

2'-F-dU фосфорамидит (также известный как DMT-2'-F-dU фосфорамидит, CAS 146954-75-8) представляет собой химически модифицированный дезоксиуридин фосфорамидитный мономер с 2'-фтор (2'-F) замещением в дезоксирибозном сахаре, 5'-O-диметокситритильной (DMT) защитной группой и β‑цианоэтил (CE) фосфорамидит в 3’-положении. Уридиновое основание присутствует без какой-либо защитной группы экзоциклического амина (в отличие от цитидина или аденозина), что упрощает синтез и снятие защиты с олигонуклеотидов, содержащих эту модификацию. Модификация 2'-фтора является одной из наиболее мощных химических модификаций для повышения устойчивости к нуклеазам и термической стабильности в олигонуклеотидной терапии. Высокоэлектроотрицательный атом фтора в 2'-положении фиксирует сахар в C3'-эндо (РНК-подобной) конформации, которая заранее организует олигонуклеотидный остов для прочного связывания с комплементарными мишенями РНК. 2'-F-dU Фосфорамидит широко используется в синтезе миРНК, антисмысловых олигонуклеотидов (АСО) и аптамеров, особенно там, где необходимо тиминоподобное основание, но с повышенным сродством связывания с аденозином.

1,2-Диолеоил-3-триметиламмоний-пропан (хлоридная соль), обычно называемый хлоридом DOTAP, представляет собой катионный липид, широко известный за его роль в доставке нуклеиновых кислот. Структурно молекула имеет головную группу четвертичного аммония, которая несет постоянный положительный заряд, две 18-углеродные олеоильные цепи (C18:1), каждая из которых содержит одну двойную цис-связь, и хлоридный противоион, который уравновешивает общий заряд. Хвосты ненасыщенных жирных кислот вносят изломы в ацильные цепи, увеличивая текучесть мембран и способствуя слиянию липосом с клеточными мембранами. Хлоридная форма 1,2-диолеоил-3-триметиламмонийпропана (хлоридная соль) является предпочтительной формулой для биологических применений, поскольку противоион хлорида обеспечивает растворимость в воде и совместимость с физиологическими условиями - в отличие от плохо растворимых форм йодистой соли. Такое сочетание постоянного катионного заряда и гибких ненасыщенных хвостов делает 1,2-диолеоил-3-триметиламмоний-пропан (хлоридную соль) исключительно эффективным строительным блоком для создания липосом и липидных наночастиц (ЛНЧ) для доставки генов.

Фосфорамидит Bz-rC (также известный как фосфорамидит DMT‑2’‑O‑TBDMS‑rC(Bz), CAS 118380-84-0) представляет собой стандартный рибонуклеозидный фосфорамидитный мономер, используемый в твердофазном синтезе РНК. Молекула имеет защитную группу 2'-O-TBDMS (трет-бутилдиметилсилил) на рибозном сахаре, защитную группу экзоциклического амина N4-бензоил (Bz) на основании цитозина, защитную группу 5'-O-диметокситритил (DMT) в 5'-гидроксильном положении и β-цианоэтил (CE) фосфорамидитную функциональность в 3'-положении. N4-бензоильная группа является одной из наиболее широко используемых стратегий защиты экзоциклического амина цитозина, обеспечивая надежную защиту от нежелательного ацилирования и реакций разветвления во время сборки олигонуклеотидной цепи. Группа 2’-O‑TBDMS является классической защитной группой для 2’-гидроксила в синтезе РНК, обеспечивая превосходную селективность при снятии защиты и совместимость со стандартными циклами твердофазного синтеза. Фосфорамидит Bz-rC является предпочтительным строительным блоком для исследователей, которым требуется высокоточное включение остатков цитидина в синтетические олигонуклеотиды РНК для различных приложений, от структурной биологии до РНК-терапии.

2'-O-метил-rA(N-Bz) фосфорамидит (также известный как DMT-2'-O-метил-rA(Bz) фосфорамидит, CAS 110782-31-5) представляет собой химически модифицированный рибонуклеозидный фосфорамидитный мономер с 2'-O-метиловой модификацией сахара рибозы, защищающий N6-бензоил (Bz) экзоциклический амин. группа на адениновом основании и стандартная 5'-O-диметокситритильная (DMT) защитная группа в 5'-гидроксильном положении с β-цианоэтиловой (CE) фосфорамидной функциональностью в 3'-положении. 2'-О-метиловая модификация является одной из наиболее широко охарактеризованных и широко используемых модификаций сахара в химии олигонуклеотидов; эта замена увеличивает термическую стабильность дуплексов, образованных с комплементарными нитями РНК, и придает значительную устойчивость к деградации, опосредованной нуклеазой, без изменения свойств спаривания оснований Уотсона-Крика. Жесткий бициклический аденозиновый каркас в сочетании с метоксигруппой в 2'-положении фиксирует сахар в С3'-эндо (РНК-подобной) конформации, которая предварительно организует остов олигонуклеотида для оптимальной гибридизации с целевыми последовательностями РНК. Бензоильная защитная группа в положении N6 аденинового основания обеспечивает надежную защиту во время твердофазного синтеза олигонуклеотидов от нежелательных побочных реакций, а группа 5'-O-DMT обеспечивает легкую очистку с помощью обращенно-фазовой хроматографии или тритиловых картриджей. Таким образом, 2'-O-метил-rA(N-Bz) фосфорамидит является предпочтительным строительным блоком для исследователей, стремящихся внедрить сайт-специфичные модификации 2'-O-метиладенозина в РНК, миРНК, антисмысловые олигонуклеотиды (ASO), аптамеры и другие химически модифицированные терапевтические средства на основе нуклеиновых кислот.

Продукт представляет собой 2'-OMe-U фосфорамидит (5'-O-(4,4'-диметокситритил)-2'-O-метилуридин-3'-O-[(2-цианоэтил)-(N,N-диизопропил)]-фосфорамидит). Это модифицированный фосфорамидит РНК, в котором метильная группа заменяет водород на 2'-гидроксиле уридинрибозного сахара. Эта, казалось бы, незначительная модификация 2'-O-метила (2'-OMe) кардинально меняет свойства нуклеотида: она увеличивает устойчивость олигонуклеотида к деградации нуклеазой, снижает иммунную стимуляцию и повышает аффинность связывания с комплементарной РНК. 2'-OMe-U фосфорамидит является стандартным реагентом для введения этой полезной модификации в последовательности РНК во время твердофазного синтеза.

5'-O-(4,4'-диметокситритил)-N4-бензоил-2'-дезокси-5-метилцитидин-3'-O-(O-2-цианоэтил-N,N-диизопропиламино) фосфорамидит (обычно сокращенно DMT-dC(Bz,5-Me) фосфорамидит, CAS 105931-57-5) представляет собой модифицированный дезоксирибонуклеозидфосфорамидитный мономер, содержащий 5-метилцитозиновое основание с N4-бензоильной защитной группой, 2'-дезоксирибозный сахар, 5'-O-диметокситритильную (DMT) защитную группу и β-цианоэтилфосфорамидит в 3'-положении. Модификация 5-метилцитозина естественным образом встречается в ДНК в качестве эпигенетического маркера (метилирование CpG), а также широко используется в химии антисмысловых олигонуклеотидов (ASO) для повышения устойчивости к нуклеазам и модуляции аффинности связывания. При включении в олигонуклеотиды пары оснований 5-метилцитозина с гуанином имеют стандартную геометрию Уотсона-Крика, но не распознаются в качестве субстрата для некоторых ДНК-метилтрансфераз, в зависимости от контекста последовательности. 5'-O-(4,4'-Диметокситритил)-N4-бензоил-2'-дезокси-5-Метилцитидин-3'-O-(O-2-цианоэтил-N,N-диизопропиламино)фосфорамидит является важным строительным блоком для синтеза CpG-содержащих олигонуклеотидов с определенным характером метилирования, а также для антисмысловых лекарств, в которых 5-метил снижает групповую иммуностимуляцию. и повышает термостабильность дуплекса.