5'-О-(4,4'-Диметокситритил)-N4-бензоил-2'-дезокси-5-Метилцитидин-3'-О-(О-2-цианоэтил-N,N-диизопропиламино)фосфорамидит

5'-O-(4,4'-Диметокситритил)-N4-бензоил-2'-дезокси-5-Метилцитидин-3'-O-(O-2-цианоэтил-N,N-диизопропиламино)фосфорамидит является стандартным мономером для введения 5-метил-2'-дезоксицитидиновых остатков в синтетическую ДНК и антисмысловые олигонуклеотиды. Бензоильная группа N4 защищает экзоциклический амин цитозинового основания, предотвращая реакции разветвления во время твердофазного синтеза. 5-метильная группа цитозинового кольца повышает термостабильность дуплексов, образуемых с комплементарной ДНК или РНК (ΔTm ≈ +0,5–1,0°С на модификацию) и, что немаловажно, снижает иммуностимулирующий потенциал CpG-мотивов при использовании в антисмысловых или CpG-вакцинах. 5'-O-(4,4'-диметокситритил)-N4-бензоил-2'-дезокси-5-метилцитидин-3'-O-(O-2-цианоэтил-N,N-диизопропиламино)фосфорамидит полностью совместим со стандартными циклами синтеза ДНК (время связывания 2–3 минуты, активатор, такой как тетразол или DCI) и стандартными условиями снятия защиты (концентрированный NH₃, 55°С, 8–16 ч). 5'-O-(4,4'-диметокситритил)-N4-бензоил-2'-дезокси-5-метилцитидин-3'-O-(O-2-цианоэтил-N,N-диизопропиламино)фосфорамидит также является ключевым промежуточным продуктом в синтезе олигонуклеотидов, содержащих заблокированную нуклеиновую кислоту (LNA), в сочетании с другими модифицированными мономерами. Этот фосфорамидит часто используется при производстве антисмысловых лекарств, одобренных FDA, а также в исследовательских целях, изучающих эпигенетическую регуляцию и анализ метилирования ДНК.

Параметры продукта

Гарантия качества в Cosperpharm

Каждая партия проходит:

● Газовая хроматография (ГХ) – чистота ≥97,0 %.

● Неводное титрование – чистота ≥97,0%.

● Показатель преломления – подтверждающий анализ.

● 1H ЯМР – структурная проверка.

● Внешний вид – прозрачная жидкость от бесцветного до светло-желтого или светло-оранжевого цвета.

Каждая поставка сопровождается полным сертификатом подлинности, паспортом безопасности (с полной информацией GHS) и сертификатом происхождения.

Условия хранения

5'-О-(4,4'-Диметокситритил)-N4-бензоил-2'-дезокси-5-Метилцитидин-3'-О-(О-2-цианоэтил-N,N-диизопропиламино)фосфорамидит хранят в плотно закрытой таре в инертной атмосфере (азот или аргон) при температуре –20°С для длительного хранения. Кратковременное хранение (до 3 месяцев) при температуре 2–8°C в условиях высыхания может быть приемлемым, но не рекомендуется в течение длительного времени. Храните контейнер в сухом, защищенном от света и вдали от сильных окислителей и кислот. Состав очень чувствителен к влаге; открываются только в безводных условиях (бардачок или с продувкой аргоном). После открытия немедленно верните неиспользованный материал в атмосферу –20°C в атмосфере аргона.

Срок годности: 2–3 года при хранении при температуре –20°C в герметичном, продуваемом инертной средой контейнере с влагопоглотителем.

Меры предосторожности при обращении: Использовать в вытяжном шкафу. Наденьте нитриловые перчатки, защитные очки и лабораторный халат. Избегайте образования пыли. Мойте руки после работы. Полную информацию по безопасности см. в паспорте безопасности.

Преимущества продукта

1. 5-метилцитозин для повышения стабильности дуплекса и устойчивости к нуклеазам.

5-метильная группа в основании цитозина увеличивает температуру плавления (Tm) дуплексов ДНК/ДНК и ДНК/РНК примерно на 0,5–1,0°С на модификацию. Эта термостабилизация особенно ценна для антисмысловых олигонуклеотидов, где более высокая аффинность связывания приводит к повышению эффективности и снижению необходимой дозы. Метильная группа также придает повышенную устойчивость к определенным нуклеазам.

2. Снижение иммуностимуляции мотивов CpG.

Неметилированные динуклеотиды CpG распознаются Toll-подобным рецептором 9 (TLR9) в иммунных клетках человека, что приводит к нежелательным иммуностимулирующим эффектам. Включение 5-метилцитозина в мотивы CpG (преобразование CpG в 5-meCpG) устраняет распознавание TLR9, уменьшая высвобождение нецелевых цитокинов в приложениях антисмысловых и siRNA. 5'-O-(4,4'-диметокситритил)-N4-бензоил-2'-дезокси-5-метилцитидин-3'-O-(O-2-цианоэтил-N,N-диизопропиламино)фосфорамидит обеспечивает эту важную иммуномодуляцию.

3. Полная совместимость со стандартным синтезом ДНК и снятием защиты.

5'-O-(4,4'-Диметокситритил)-N4-бензоил-2'-дезокси-5-метилцитидин-3'-O-(O-2-цианоэтил-N,N-диизопропиламино)фосфорамидит использует ту же схему защитных групп, что и стандартный 2'-дезоксицитидин фосфорамидит (DMT на 5', Bz на N4, CE на 3'), с единственным разница заключается в 5-метильном заместителе. Поэтому никаких изменений в циклах синтеза, растворах активатора или условиях снятия защиты не требуется — он без проблем работает на всех стандартных синтезаторах ДНК.

4. Необходим для исследований метилирования CpG-островков.

В эпигенетических исследованиях олигонуклеотиды с определенным набором 5-метилцитозина используются в качестве субстратов для метилтрансфераз, стандартов для бисульфитного секвенирования и зондов для метилсвязывающих белков. 5'-O-(4,4'-диметокситритил)-N4-бензоил-2'-дезокси-5-метилцитидин-3'-O-(O-2-цианоэтил-N,N-диизопропиламино)фосфорамидит позволяет исследователям синтезировать специально метилированные последовательности ДНК без ферментативного метилирования, что часто дает неполные или гетерогенные структуры.

5. Терапия антисмысловыми олигонуклеотидами.

Некоторые антисмысловые препараты, одобренные FDA (например, нузинерсен, инотерсен), содержат остатки 5-метилцитозина для повышения стабильности и снижения иммуногенности. 5'-O-(4,4'-диметокситритил)-N4-бензоил-2'-дезокси-5-метилцитидин-3'-O-(O-2-цианоэтил-N,N-диизопропиламино)фосфорамидит является предпочтительным мономером для производства таких терапевтических средств в коммерческих масштабах.

Связаться с нами

Ищете надежного поставщика 5'-O-(4,4'-диметокситритил)-N4-бензоил-2'-дезокси-5-метилцитидин-3'-O-(O-2-цианоэтил-N,N-диизопропиламино)фосфорамидита? Cosperpharm готов предоставить качественный продукт, полную документацию и оперативную техническую поддержку.