Bz-rC Фосфорамидит

Фосфорамидит Bz-rC является фундаментальным мономером для химического синтеза олигонуклеотидов РНК. Защитная группа N4-бензоила на основании цитозина предотвращает разветвление и обрыв цепи во время цикла сочетания фосфорамидита, в то время как группа 2'-O-TBDMS защищает 2'-гидроксил на протяжении всей сборки цепи и удаляется после синтеза с использованием реагентов на основе фторида, таких как тригидрофторид триэтиламина (TEA · 3HF). Фосфорамидит Bz-rC совместим со стандартными протоколами синтеза РНК на автоматических синтезаторах ДНК/РНК (например, Applied Biosystems, MerMade, Dr. Oligo), обычно с использованием 0,25 М растворов активатора (5-этилтио-1H-тетразол, 4,5-дицианоимидазол) и временем связывания 5–10 минут. Фосфорамидит Bz-rC был широко проверен при синтезе РНК для структурных исследований, антисмысловых олигонуклеотидов, миРНК и аптамеров. Фосфорамидит Bz-rC также используется в качестве эталонного стандарта при определении профиля примесей олигонуклеотидов, поскольку бензоильная группа может давать характерные побочные продукты (например, продукты N4-бензоил-депиримидинирования), которые необходимо контролировать во время разработки процесса.

Параметры продукта

Гарантия качества в Cosperpharm

Каждая партия проходит:

● Газовая хроматография (ГХ) – чистота ≥97,0 %.

● Неводное титрование – чистота ≥97,0%.

● Показатель преломления – подтверждающий анализ.

● 1H ЯМР – структурная проверка.

● Внешний вид – прозрачная жидкость от бесцветного до светло-желтого или светло-оранжевого цвета.

Каждая поставка сопровождается полным сертификатом подлинности, паспортом безопасности (с полной информацией GHS) и сертификатом происхождения.

Часто задаваемые вопросы

Вопрос 1: В чем разница между фосфорамидитом Bz-rC и фосфорамидитом Ac-rC?

A: Фосфорамидит Bz-rC использует бензоильную (Bz) защитную группу на экзоциклическом амине N4 цитозина, тогда как Ac-rC использует ацетильную (Ac) группу. Бензоильная группа обеспечивает большую защиту от депиримидинирования в кислых условиях удаления ДМТ (3% трихлоруксусная кислота в дихлорметане). Для большинства применений синтеза РНК бензоильная группа предпочтительна для длинных последовательностей или последовательностей, богатых дезоксицитидином.

Вопрос 2: Каково рекомендуемое время соединения фосфорамидита Bz-rC со стандартным синтезатором?

A: В стандартных условиях синтеза РНК с 0,25 М активатором (например, 5-этилтио-1H-тетразолом или 4,5-дицианоимидазолом) время связывания 5–10 минут типично для фосфорамидита Bz-rC. Для более длинных олигонуклеотидов (>40-мер) или высокопроизводительного синтеза оптимизация концентрации активатора и времени связывания может улучшить выходы.

Сценарии применения продукта

1. Синтез РНК-олигонуклеотидов.

Фосфорамидит Bz-rC является стандартным строительным блоком для введения остатков цитидина в синтетические олигонуклеотиды РНК для исследований, диагностики и терапевтических разработок.

2. Производство миРНК

Используется для включения 2'-ОН-цитидина в дуплексы миРНК. Группа TBDMS удаляется после синтеза, что дает полностью нативную РНК для исследований РНКи.

3. Синтез антисмысловых олигонуклеотидов (АСО).

ASO, нацеленные на транскрипты РНК, требуют сегментов РНК (например, в конструкциях гэпмеров). Фосфорамидит Bz-rC поставляет необходимые остатки цитидина с полной нуклеазной устойчивостью, если его оставить в виде 2'-ОН или модифицировать.

4. Генерация аптамеров РНК

Библиотеки аптамеров и отдельные кандидаты на аптамеры химически синтезируются с использованием фосфорамидита Bz-rC для обеспечения точности последовательности и масштабируемости.

5. Структурная биология Подготовка РНК

Для рентгеновской кристаллографии и ЯМР-исследований необходимо синтезировать четко определенные последовательности РНК с высокой чистотой. Фосфорамидит Bz-rC обеспечивает необходимую эффективность связывания и чистоту снятия защиты.

6. Эталонный стандарт для определения профиля примесей

В качестве потенциальной технологической примеси в олигонуклеотидных лекарственных веществах (например, остаточном N4-бензоил-цитидине, продуктах неполного снятия защиты) фосфорамидит Bz-rC или его производные со снятой защитой служат эталонными стандартами в методах ВЭЖХ и ЖХ-МС.

Связаться с нами

Готовы заказать фосфорамидит Bz-rC для вашего следующего проекта по синтезу РНК? Команда Cosperpharm готова обсудить ваши требования к чистоте, потребности в документации и сроки доставки.